Теперь удмуртские племенные хозяйства отбирают животных по комплексному индексу из 7 геномных оценок. На сегодня более 120 тысяч живых животных уже оценены с помощью расширенного селекционного индекса MBI.
Проект геномной селекции в молочном скотоводстве Удмуртии длится уже 2,5 года. Первый индекс был представлен в 2021 году и состоял из 4 оценок. Сейчас оператор проекта по внедрению геномной селекции в Удмуртии, компания Кситест, представила обновлённый селекционный индекс MBI — Milk Breeding Index, включающий 7 племенных оценок. С его помощью можно оценить животное сразу по комплексу важнейших для российского производителя качеств. Это позволяет хозяйствам точнее ранжировать животных и отбирать в племядро только тех, которые действительно принесут прибыль в российских экономических реалиях.
Оценки, которые были в индексе 2021 года:
- удой за 305 дней лактации;
- жир;
- белок;
- продуктивное долголетие.
Оценки, которые добавились в 2022 году:
- межотёльный интервал;
- фертильность молодняка;
- фертильность коров.
В индекс в этом году добавились оценки по фертильности и межотёльный интервал, что позволяет отбирать животных по комплексу оценок «продуктивность-фертильность», тем самым снижая количество затрат на осеменение животных. Также в индексе этого года учитываются затраты на семя, биологические различия в количестве потребляемых кормов при разной продуктивности и цена среднего рациона для дойной и сухостойной коровы. При повышении продуктивности животное приносит больше маржинальности за счёт того, что общие затраты не меняются.
«Сегодня мы совершенно чётко понимаем объём предстоящей работы. Мы только в начале пути, но на сегодня в проекте участвуют 14 племенных хозяйств, 2 станции искусственного осеменения, генотипировано более 15 000 животных. Селекционеры хозяйств используют геномную информацию при отборе животных для воспроизводства, станции ведут закрепление производителей с учётом генетической сочетаемости пар и формируют здоровую популяцию с высоким потенциалом. В регионе построена экосистема геномной селекции: генетические станции, министерство и племенные хозяйства работают вместе для достижения лучшего результата», — Ольга Викторовна Абрамова, заместитель Председателя Правительства Удмуртской Республики.
Для расчёта нового индекса команда биоинформатиков Кситест создала экономическую модель хозяйства, которая учитывает экономику производства: источники прибыли, такие как выручка с продажи молока, племпродажи и продажи на мясокомбинат, а также затраты на кормление, осеменение, ремонт стада и прочие.
Благодаря новым факторам, включённым в расчёт, экономическая модель стала более гибкой и учитывает все необходимые затраты в уравнении прибыли.
«Чтобы получить экономические веса для каждой оценки в индексе, мы брали средние показатели и стандартные отклонения признаков животных, затем по уравнению экономической модели хозяйства и отклонениям рассчитывали, какова скорость изменения каждого оцениваемого признака при условии, что все остальные показатели остаются без изменения. Это позволило выявить важность каждого из признаков в получении прибыли в российских экономических условиях», — Ксения Максимова, биоинформатик Кситест.
На сегодня в MBI большую часть занимают продуктивные качества и меньшую — функциональные качества и долголетие. Это объясняется тем, что в текущую версию индекса не входят оценки по линейным признакам, тогда как в других странах они включены в раздел «Функциональные качества и долголетие». Если сравнивать долю истинного долголетия, то в среднем в других странах она также составляет 12 % от всего индекса. Линейные признаки планируется добавить в MBI в ближайшие 1−2 года, согласно дорожной карте проекта по внедрению геномных оценок в Республике Удмуртии.
В Кситест также оценили, как общий индекс коррелирует с отдельными оценками в его составе и с индексом прошлого года.
По графику видно, что индекс хорошо коррелирует с оценками, отвечающими за получение прибыли — это удой и компоненты молока (74−76 %). Отрицательная корреляция наблюдается по оценкам, которые необходимо уменьшать для достижения лучшего результата (например, межотёльный интервал — чем он меньше, тем это выгоднее хозяйству).
Для хозяйств, которые уже работают с MBI, переход от индекса 2021 года к индексу 2022 года будет плавным, так как корреляция индекса с версией прошлого года высокая — 81 %. При этом часть животных получат более высокий индекс, чем ранее, благодаря учёту показателей фертильности.
На сегодня MBI — Milk Breeding Index — наиболее точный рублёвый индекс для оценки животных, рассчитанный по мировым стандартам и алгоритмам BLUP и ssGBLUP. Данный индекс уже рассчитан для 124 211 живых животных.
«У каждого европейского государства разработан собственный индекс и есть собственная локальная референтная база, по которой они оценивают животных. Причина в том, что оценка с учётом локальных условий среды, экономики и условий содержания животных всегда более точна, чем оценка по референтной базе другой страны. И, как итог, такой отбор гораздо выгоднее и для отдельного хозяйства, и для региона, и для страны. Уже сейчас мы предлагаем российским животноводам вести селекцию на самом современном уровне. Геномные инструменты позволят через 3−5 лет значительно сократить импортозависимость от зарубежного семени и животных», — Дарья Яковишина, генеральный директор Кситест.
Оценка животных по индексу MBI — это оценка по самой большой российской референтной базе геномов молочного скота, которая на сегодня содержит более 500 000 фенотипов животных и 30 874 генотипа. Для сравнения, референтная база Венгрии на сегодня содержит 33 491 животное с генотипом.